自2017年初，高通与苹果合作关系破裂开始，双方围绕专利授权费展开了多次诉讼交锋。主要纠纷围绕着高通的技术授权业务而展开，苹果指控高通的知识产权授权模式不合理，而高通则指责苹果使用了高通的专利却不付钱。高通和苹果之前已经在美国、中国等地发起了多场官司。
近年来，高通芯片加专利的收费模式一直被质疑，直接导致苹果使用英特尔的芯片代替高通，华为、三星等手机厂商也停止向高通支付专利费，邀请高通重新谈判专利授权模式，再加上英特尔、联发科、华为海思等芯片的崛起，高通的霸主地位受到冲击。从最新的消息看，很可能错失5G首发机会的苹果并没有打算“妥协”，目前仍未与高通展开和解谈判。
受此影响，高通的净利润在第四财季同比转亏。数据显示，高通公司第四财季亏损4.93亿美元，合每股亏损35美分；上年同期实现利润1.68亿美元，合每股收益11美分。第四财季支出管理不力，总成本增长16%，至64.6亿美元。
从全年来看，高通遭遇了上市以来的首次亏损，2018财年高通收入227.32亿美元，同比2017财年的222.91亿美元增长2%，但在利润方面亏损了48.64亿美元，而在2017财年，高通利润为24.66亿美元。在2014年的巅峰期，高通曾创造了接近80亿美元的净利润。
根据财报，造成高通巨亏的主要原因并非经营层面，而主要在于美国《就业与减税法案》以及NXP的收购失败。《就业与减税法案》对美国公司的海外利润加收15.5%税率的一次性征税，由于绝大多数收入来自海外，高通因此缴纳了60亿美元的巨额税收；除此之外，NXP的收购失败，又让高通支付了20亿美元的分手费。除此之外，还有来自欧盟反垄断处罚的12亿美元罚款，以及为企业重组支出的6.87亿美元重组费用。
财报数据显示，2018财年高通芯片出货量8.55亿颗，同比增长6%；芯片业务收入173亿美元，同比增长了5%。再看高通2017财年的表现，芯片销量8.04亿颗，同比2016财年的8.42亿颗下滑5%。单纯看销量的话，高通2018财年手机芯片的销量比2016年的增长相当有限，只能说是小幅增长。从营收上来看，高通芯片带来的收入占总营收的一半以上，但利润却不及专利授权业务。
三星猎户座芯片的成熟，联发科新款手机芯片竞争力的加强，英特尔对移动业务的扶持，这都在挤压高通手机芯片的利润。另一方面，各国反垄断力度加强，为高通带来丰厚回报的专利授权费用利润率大幅下滑。当然，高通的亏损与整个手机行业不景气有关，行业增长速度已经远没有前几年迅速。多方不利的格局下，失去苹果遭受业绩重创的高通，在5G时代或面临更多的挑战。
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